Генетики проанализировали образцы отложений из грузинской пещеры Сацурблия и обнаружили древние фрагменты ДНК волка, зубра, а также человека, жившего около 25 тысяч лет назад.
Таким образом, исследователям удалось восстановить часть генома древнего человека, не имея никаких скелетных останков, пишет sciencealert.
Анализ обнаружил следы женщины, которая жила 25 000 лет назад, до последнего ледникового периода; и, хотя мы мало что знаем о ней, это представляет собой значительное научное достижение: возможность идентифицировать древние человеческие популяции, даже когда нет костей для восстановления.
В образце также была обнаружена ДНК видов волков и бизонов, которую международная группа ученых смогла включить в контекст истории их популяции.
«Наши результаты дают новое понимание позднеплейстоценовой генетической истории этих трех видов и демонстрируют, что прямое секвенирование ДНК отложений без методов целевого обогащения может дать данные по всему геному», — отметии авторы работы.
Восстановление древней ДНК обычно во многом зависело от костей и удачи. Во-первых, вам нужны кости, которые остались в достаточной степени неповрежденными, чтобы сохранить ДНК на многие тысячи лет.
Затем вам нужно найти их и восстановить достаточно генетического материала для секвенирования. Это кропотливая, но полезная работа — древняя ДНК способна заполнить множество пробелов в эволюционной истории не только людей, но и других форм жизни.
Однако многие археологические раскопки содержат больше свидетельств использования гоминидов, чем костей. Пещера Сацурблия в Грузии — одно из таких мест. Артефакты, такие как каменные орудия труда, выдерживают суровое время лучше, чем кости, так что это неудивительно. Несмотря на это, пещера использовалась древними людьми в течение тысяч лет, и все же только один геном человека из этого места был секвенирован от человека, который жил 15000 лет назад.
ДНК, которую можно найти в отложениях, все чаще становится отличным способом узнать больше о прошлом. Она откладывается с фекалиями или с фрагментами костей, измельченных в пыль.
Поэтому группа ученых во главе с биологом-эволюционистом Пере Гелабертом и археологом Роном Пинхаси из Венского университета в Австрии отправилась на поиски ДНК окружающей среды в пещере Сацурблия. Они взяли шесть образцов почвы и тщательно проанализировали их в поисках следов генетического материала. Они нашли их в виде митохондриальной ДНК. Фрагментарные и неполные, но достаточные для получения новой информации о популяциях, которые когда-то населяли этот регион.
Была восстановлена лишь крошечная часть генома женщины, но из этого исследователи смогли сделать вывод, что она была членом ранее неизвестной группы современных людей. Эта группа в настоящее время вымерла, но она внесла свой вклад в сегодняшние популяции в Европе и Азии, как было обнаружено, когда древний геном сравнивали с нынешними геномами человека.
По словам исследователей, геном волка также представляет собой ранее неизвестную, а ныне вымершую линию. Это говорит о том, что популяции волков значительно изменились в конце последнего ледникового периода, около 11000 лет назад, при этом линии, подобные этой, полностью исчезли.
Наконец, митохондриальная ДНК, обнаруженная в геноме бизона, также может быть найдена у живых современных бизонов. Исследователи обнаружили, что его геном был более тесно связан с европейским и евразийским бизонами, чем с североамериканскими бизонами — важный вывод, поскольку он предполагает, что эти две линии разошлись до времен пещерных бизонов Сацурблия.
Неизвестно, жили ли три вида в пещере вместе — на данный момент очень трудно сузить датировку с достаточной уверенностью. Кроме того, изучение ДНК окружающей среды все еще имеет некоторые существенные ограничения, такие как фрагментарный характер любого извлеченного генетического материала и высокая вероятность заражения.
Тем не менее, открытие демонстрирует, что благодаря дешевым и доступным технологиям копание в грязи может быть гораздо более полезным, чем мы когда-то считали возможным.